水平超凈臺(tái)和垂直超凈臺(tái)的工作原理是*相同的，所不同的只是外觀形式；從字面意思來(lái)理解，水平超凈臺(tái)的風(fēng)是水平的，平面的。而垂直超凈臺(tái)的風(fēng)向是垂直層流，風(fēng)是從上往下吹的。
從潔凈度上來(lái)理解：水平超凈臺(tái)和垂直超凈臺(tái)的效率是*相同的，不存在潔凈度的高低之差別。都是達(dá)到美聯(lián)邦標(biāo)準(zhǔn)的209E百級(jí)凈化。如果達(dá)不到百級(jí)凈化的超凈臺(tái)那就是一個(gè)次品。
從價(jià)格上來(lái)區(qū)分：從材料和做工的復(fù)雜程度來(lái)說(shuō)，垂直超凈工作臺(tái)要復(fù)雜一些，要費(fèi)料費(fèi)工一些，價(jià)格人略比水平的貴。
從封閉程度上來(lái)講：水平工作臺(tái)是敞開(kāi)式的，垂直超凈工作臺(tái)前面有升降玻璃擋板或有機(jī)玻璃檔板，垂直超凈臺(tái)不用的時(shí)候可以將擋板放下封閉起來(lái)。
從使用場(chǎng)所上區(qū)別：水平流目前主要是食品檢驗(yàn)，花卉、樹(shù)苗、食用菌接種組培；垂直層流應(yīng)用于電子、化工、醫(yī)院、醫(yī)藥行業(yè)。也是因?yàn)橐恍┗ぁ⒅扑幤髽I(yè)的實(shí)驗(yàn)操作過(guò)程中會(huì)有一些有毒有害氣體會(huì)影響人體健康，所以選擇往下吹風(fēng)的垂直層流而不是水一層流似乎更合適一些。